Музейная коллекция начала создаваться еще в 1939–1940 гг. по инициативе крупнейшего минералога и кристаллографа, репрессированного профессора Ленинградского горного института А. К. Болдырева, работавшего в те годы в Геолого-разведочном управлении Дальстроя. Активное участие в организации музея приняли геологи В. Ф. Алявдин, А. П. Васьковский, Е. К. Устиев, В. Н. Владимиров, И. М. Сперанская, В. Т. Матвиенко, П. И. Скорняков, братья Б. А. и Л. А. Снятковы. Первыми экспонатами коллекции были отдельные красивые образцы минералов, руд и горных пород. Позднее стали поступать научно обработанные коллекции различных типов руд и вмещающих пород, характеризующих месторождения полезных ископаемых Дальнего Востока. На их основе был сформирован первый отдел – полезных ископаемых. Первоначально музей состоял из трёх отделов – полезных ископаемых, петрографии и минералогии. Официальный статус музей приобрел в 1957 г. к открытию 1-го стратиграфического совещания. Он дополнился отделами стратиграфии и палеонтологии. Первоначально музей размещался в двух небольших комнатах Геолого-разведочного управления. При строительстве нового здания Центральной комплексной тематической экспедиции в 1983 г. музею было отведено более 200 м2 площади, где он располагается и в настоящее время. На сегодняшний день в музее три тематических зала – полезных ископаемых, палеонтологический-минералогический и петрографический и золотая комната. В научном фонде музея хранятся шлифотека (более 40 890 шлифов и аншлифов). В зале полезных ископаемых представлены месторождения рудных (золота, серебра, олова, вольфрама, меди, молибдена, железа, ртути) и нерудных (угля, строительных материалов, поделочных камней) полезных ископаемых Магаданской области, являющихся объектами добычи. Палеонтологический фонд включает в себя коллекции окаменелостей и отпечатков ископаемых флоры и фауны. В зале можно увидеть черепа бизонов, носорога, бивни мамонта, а также муляж мамонтенка Димы, найденного в 1977 г. в Сусуманском районе во время вскрыши торфов при отработке россыпного месторождения. Минералогический фонд представлен большой коллекцией агатов и самоцветов. В петрографическом зале можно ознакомиться с типовыми коллекциями пород Магаданской области. В хранилищах геологического музея насчитывается более 10 тысяч экспонатов. Имеется богатейший фонд каменного материала, собранного почти за весь период деятельности геологической службы на Северо-Востоке. Образцы руд собраны со всех колымских и чукотских месторождений: Наталкинского, Карамкенского, Школьного, Ветренского, Майского и др. Богатая коллекция самоцветов привлекает разнообразием и красотой, содержит уникальные пейзажные агаты. Гордостью музея считается «Золотая комната», экспонаты которой собираются с самого начала освоения Колымы. Здесь экспонируется уникальная эталонная коллекция золота из россыпных месторождений Северо-Востока, а также образцы самородного золота и серебра, представляющие научный или декоративный интерес: самородки необычной формы, большие кристаллические сростки золота, встречающиеся достаточно редко. Самые большие самородки теперь являются частью Алмазного фонда в Москве. Долгие годы руководил музеем заслуженный геолог РФ, ветеран северо-восточной геологоразведки М. Е. Городинский, внёсший неоценимый вклад в превращение музея в одну из главных достопримечательностей Магадана. Геологический музей неизменно входит в программу знакомства гостей Колымы с её природными богатствами. В музее регулярно проводятся экскурсии для жителей и гостей Магадана. Ведётся научно-производственная работа со студентами по истории геологического изучения территории, систематическая образовательная работа со школьниками.
СМ.: Магадан : путеводитель-справ. / [сост. Л. Комарова]. – Магадан, 1989. – С. 152; Смолина Т. Сокровищница Северо-Востока // Колым. тракт [Магадан]. – 2000. – 6 дек. (№49). – С. 6; Слатова А. «Золотая комната» Колымы // Регион [Магадан]. – 2001. – 1–7 февр. (№5). – С. 3; Штрик В. Сокровища Магадана // National Geografic. – 2009. – № 2. – С. 104–105 : цв. фот.; Геологический музей [Электронный ресурс] // Магаданский филиал ФБУ «ТФГИ по ДФО». – Режим доступа: http://mfgi.ru/index.php/geologicheskij-muzej. – 12.04.2016.
